中美合作基因测序取得重要突破 六股暴涨
来源:华讯财经 作者:佚名 2016-06-17 11:19:01
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中美合作在三代基因测序软件领域再次取得重要突破
据媒体报道,近日中美科研人员在基因测序领域的合作再次取得重要突破。针对第三代基因测序仪硬件错误率高达15%-40%的现实,该团队合作研发了一套新算法,采用新算法设计的软件所取得的结果错误率低于0.5%,同时还可节省测序时间和内存达80%。此前英特尔推出了“英特尔精准医疗伙伴计划”,有望在2020年实现24小时内完成基因测序-医学分析-制定医疗方案等一系列精准医疗过程。
针对第三代基因测序仪硬件错误率高达15%—40%的现实,该团队研发出了一套“线性复杂度”(复杂性最低)的算法,Sparc软件即基于该新算法完成。
综合测试显示:采用测序深度仅为30x的三代基因测序数据,Sparc取得组装共识(Consensus)时错误率低于0.5%;同时与目前最优秀的同类软件比,Sparc可节省计算时间和内存达80%。这一重要突破为推进基因测序技术迈向三代技术的产业升级提供了又一关键软件技术。
事实上,三代测序的错误率在15%-40%,而已经占领测序市场主流近10年的二代测序技术其错误率则低于1%。正是由于这一测序错误率的巨大差异,以及二代测序仪制造商的市场份额优势,使得三代测序技术目前远未发挥出其独特的科学和技术优势。Sparc软件能够有效弥补三代测序技术硬件超高错误率这一“硬伤”,应该能够大幅度提高三代技术的市场竞争能力,为迎接基因测序产业升级奠定优良的技术基础。
基因测序技术使得人类在本世纪初完成了对自身遗传密码蓝本的解读,其划时代意义可能不亚于阿波罗登月计划。而测序技术在人类基因组计划中的地位则类似于运载火箭技术在探月工程中所起的作用。测序技术在经过30余年的研发后目前处于第二代与第三代交替的前夜。(中国证券网)
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